Billion单细胞计划重磅开启!华大自主单细胞平台升级助力!
Billion单细胞计划重磅开启!
华大自主单细胞平台升级助力!
单细胞研究已进入规模化时代,华大科技单细胞一站式解决方案重要一环——单细胞自主平台RNA-Seq产品全新升级!通过升级的高通量细胞分选技术,DNBelab C4平台可以实现更高效细胞捕获,搭载华大自主DNBSEQ™高通量测序平台和Dr. Tom单细胞全交互式数据挖掘交付系统,进行高性价比单细胞转录组文库测序和数据分析挖掘,可广泛应用于研究组织异质性、胚胎发育、克隆进化、疾病机理和免疫微环境等,助力科研成果快速发表。
近日,华大自主DNBelab C4单细胞平台RNA-Seq助力中国科学家实现继诺奖后的干细胞研究重大突破,研究成果于昨日正式在Nature发表(详情点击), 该平台采用的RNA-Seq技术是如何成功助力科学家摘下科研界 “桂冠”呢?让我们一一揭幕其重要技术及服务优势。
升级亮点
1
稀有细胞高效捕:高效捕获稀有类型细胞,实现新突破;
2
多种样本无挑剔:除常规活细胞悬液外,珍稀液氮速冻样本皆可实现细胞核水平研究;
3
测序数据高保真:搭配DNBSEQ™测序系统,不怕单个细胞数据弄混;
4
自主分析不求人:Dr. Tom交互式单细胞数据挖掘系统支持;
5
服务模式一站达:流式分选服务服务助力目的细胞分选,一站式实现从组织到细胞数据获取及细胞群验证。
服务全流程
图1 DNBelab C4平台单细胞RNA-Seq服务全流程
实力还是靠数据说话
灵敏分选“成效”
高效捕获稀有类型细胞。将两种不同状态的人多功能干细胞(PPSCs以及NPSCs)以99:1的比例混合后,进行DNBelab C4单细胞RNA文库制备和测序,最后鉴定到NPSCs细胞比例为1.3%,表明该平台具备可靠的罕见细胞捕获能力。
图2 各类细胞分选检出比例
多种样本“成行”
除常规单细胞悬液外,液氮速冻提核样本皆可实现单细胞水平研究。采用液氮速冻的肺组织样本,提取细胞核,进行DNBelab C4平台单细胞分选建库及测序,共获得12,822个细胞核,每个细胞核检测基因数中位数1,000以上,助力珍稀样本实现单细胞(核)水平研究。
图3 液氮速冻肺组织样本提取细胞核分选结果展示
细胞分群“成立”
与相同类型样本在其他平台已发表分群结果重合度高。DNBelab C4平台对人外周血PBMC样本进行高效细胞分选和转录组建库测序,所得单细胞数据UMAP降维分群后,与2020年Nature Biotechnology已发表文章人PBMC细胞分类及注释结果均一致[1]。
图4 DNBelab C4平台的细胞分群对比
多篇高分“成果”
DNBelab C4平台累计发表文章13篇,平均影响因子高达14分以上,其中10分以上高分文章多达6篇。
图5 DNBelab C4平台发表文章列表
送样建议
图6 DNBelab C4平台适用样本和要求
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参考文献:
[1] Ding Jiarui,Adiconis Xian,Simmons Sean K et al. Systematic comparison of single-cell and single-nucleus RNA-sequencing methods.[J] .Nat Biotechnol, 2020, 38: 737-746.
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